ФІЛОГЕНЕТИЧНИЙ АНАЛІЗ ІЗОЛЯТІВ ВІРУСІВ МОЗАЇКИ ЦИМБІДІУМУ ТА КІЛЬЦЕВОЇ ПЛЯМИСТОСТІ ОДОНТОГЛОСУМУ, ВИДІЛЕНИХ ІЗ ОРХІДНИХ PHALAENOPSIS SP.
DOI 10.17721/1728.2748.2021.87.56-61
Ключові слова:
орхідні, CymMV, ORSV, ЗТ-ПЛР, філогенетичний аналізАнотація
Віруси мозаїки цимбідіуму та кільцевої плямистості одонтоглосуму є найбільш патогенними та широко поширеними вірусами в колекціях декоративних орхідних. Інфекції, спричинені цими вірусами, можуть призвести до зниження видового різноманіття колекцій і, як наслідок, їх повного виснаження. Метою дослідження було визначення походження українських ізолятів вірусів орхідних у колекції захищеного ґрунту Ботанічного саду імені О. В. Фоміна Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Вивчено нуклеотидні та амінокислотні послідовності гена капсидного білка (CP) вірусу мозаїки цимбідіуму (CymMV) та CP вірусу кільцевої плямистості одонтоглосуму (ORSV). Ці послідовності були отримані в результаті ампліфікації і сиквенування РНК CymMV та ORSV, виділених із інфікованих рослин Phalaenopsis sp. колекції захищеного ґрунту Ботанічного саду ім. О. В. Фоміна Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Отримані сиквенси порівнювали з послідовностями відомих ізолятів CymMV та ORSV із ГенБанку. Було встановлено, що досліджуваний ізолят ORSV має подібність з іншими ізолятами 96–99 % та 93,4–98 % для CP на нуклеотидному й амінокислотному рівнях, відповідно. Виділений ізолят CymMV мав ступінь подібності з іншими ізолятами CymMV 77–97 % для нуклеотидних та 84–100 % – для амінокислотних послідовностей. Побудоване філогенетичне дерево показало, що обидва досліджувані віруси, CymMV та ORSV, мають спільне походження з деякими корейськими ізолятами.
Посилання
Zettler FW, Wistler GC, Elliot MS, Ko N-J. Viruses of orchids and their control, Plant. Disease; 1990; 74: 621-626.
Chia-Hwa Lee, You-Xiu Zheng, and Fuh-Jyh Jan The Orchid-Infecting Viruses Found in the 21st Century Orchid Biotechnology III. March 2017; 145-164 :https://doi.org/10.1142/9789813109223_0009
Bratsch SA, Olszewski N, Lockhart B. Incidence of cymbidium mosaic, odontoglossum ringspot, and orchid fleck virus in orchids in Minnesota and production of antibodies for use in ELISA to detect orchid fleck virus. European Journal of Plant Pathology. 2021; 159 (3): 543-554.
Olmedo-Velarde A, Roy A, Padmanabhan Ch, Nunziata S., Nakhla MK and Melzer MJ First Report of Orchid Fleck Virus Associated with Citrus Leprosis Symptoms in Rough Lemon (Citrus jambhiri) and Mandarin (C. reticulata) the United States.Plant Disease . Sep. 2021. https://doi.org/10.1094/PDIS-12-20-2736-PDN
Cánovas SE, Ballari MC and Nome CF. First report of Cymbidium mosaic virus and Odontoglossum ring spot virus in Argentina. Australasian Plant Dis. Notes. 2016. 11: 2. http://dx.doi.org/10.1007/s13314-015-0189-7.
Lopez-Hernandez MS, PALACIOS-POPO P.E., DE LA TORREALMARAZ R [Detection of Cymbidium mosaic virus (CymMV) and Odontoglossum ringspot virus (ORSV) from orchids in Mexico]. Agrociencia [online]. 2014, vol.48, n.5, pp.525-536. ISSN 2521-9766.
Pradhan Sh, Regmi T, Ranjit M, Pant B, Production of virus-free orchid Cymbidium aloifolium (L.) Sw. by various tissue culture techniques, Heliyon, Volume 2, Issue 10, 2016, e00176, ISSN 2405-8440, https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2016.e00176.
Chung B-N, Yoon J-Y., Kim MS. Viral infection of tissue cultured orchids and evaluation of damages, Plant. Pathol. J., 2010; 26(2); 194-197.
Korotieieva HV, Polischuk VP. [Viral diseases in the orchid collection of Academician O.V. Fomin Botanical Gardens of Taras Shevchenko Kyiv National University] [Scientific Notes of NaUKMA]. 2001;19,(2): 399-400. Ukrainian
Polischuk V, Korotyeyeva G, Bysov A, Lavrentieva A Spreading of virus infection in the orchid collection in Ukraine. Plant science. Sofia. 2007; XLIV (3). : 213-216.
Lim S.T., Wong S.M., Yeong C.Y., Lee S.C., Goh CJ. Rapid detection of cymbidium mosaic virus by the polymerase chain reaction (PCR). J Virol Methods. 1993 Jan; 41(1):37-46. doi: 10.1016/0166-0934(93)90161-j. PMID: 8432762.
Pearson MN., Cole JS Further Observations on the Effects of Cymbidium Mosaic Virus and Odontoglossum Ringspot Virus on the Growth of Cymbidium Orchids, Journal of Phytopathology, 2008; 31 (3):193-198. Available at: https://doi.org/10.1111/j.1439-0434.1991.tb01187.x
Yamane K, Oyama K, Iuchi E, Ogawa H, Suzuki T and Natsuaki T. RT-PCR Detection of Odontoglossum ringspot virus, Cymbidium mosaic virus and Tospoviruses and Association of Infections with Leaf-Yellowing symptoms in Phalaenopsis. Journal of Phytopathology 2008; 156: 268–273. http://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0434.2007.01352.x
Hu JS, Ferreira S, Xu MQ, Detection of Cymbidium Mosaic Virus, Odontoglossum Ringspot Virus, Tomato Spotted Wilt Virus, and Potyviruses Infecting Orchids in Hawaii, Department of Plant Pathology. 1993:464-468. https://www.apsnet.org/publications/PlantDisease/BackIssues/Documents/1993Articles/PlantDisease77n05_464.PDF
Yoon JY, Chung BN, Choi SK. High sequence conservation among Odotoglossum ringspot virus isolates from orchids, Virus Genes, 2011; 42(2): 261-267.
Chng CG, Wong S M, Mahtani P H, Loh C S, Goh C J, Kao M C, Chung M C, Watanabe Y. The complete sequence of a Singapore isolate of odontoglossum ringspot virus and comparison with other tobamoviruses. Gene, 1996; 171: 155–161
Moles M, Delatte H, Farreyrol K, Grisoni M. Evidence that Cymbidium mosaic virus (CymMV) isolates divide into two subgroups based on nucleotide diversity of coat protein and replicas genes, Arch. Virol, 2007; 152: 705-715.
