ФІЛОГЕНЕТИЧНИЙ АНАЛІЗ ІЗОЛЯТІВ ВІРУСУ ЖОВТОЇ МОЗАЇКИ КВАСОЛІ З ГЛАДІОЛУСІВ В УКРАЇНІ

Анотація

Вірус жовтої мозаїки квасолі (ВЖМК) є одним із найбільш поширених та шкодочинних вірусів, що уражують рослини гладіолусів у світі. Метою роботи було провести філогенетичний аналіз двох українських ізолятів ВЖМК, виділених із гладіолусів різних областей України та визначити філогенетичні зв’язки ізолятів з іншими ізолятами цього вірусу. У дослідженні були використані методи: візуальна діагностика, імуноферментний аналіз у модифікації сендвіч, виділення тотальної РНК, ЗТ-ПЛР, філогенетичний аналіз, статистичні методи обробки даних. Результати досліджень показали, що гладіолуси сорту Пам’ять (Полтавська область, 2018) та сорту Галина Зеленобірська (Київська обл., 2020) з симптомами хлоротичної штрихуватої мозаїки на листках і розриву кольору квітки інфіковані ВЖМК.  Послідовності фрагмента гена CP українських гладіолусних ізолятів вірусу жовтої мозаїки квасолі, названі GlMP-18 (MK416160) та BYMV-Gl-SV-20 (MZ286966), депоновані до NCBI GenBank. Нуклеотидні послідовності цих ізолятів, які відповідають ділянці гена СР розміром 578 нуклеотидів, локалізованій у позиціях 8727–9305 вірусного геному, а також амінокислотні послідовності, порівняні з 40 відомими ВЖМК ізолятами/штамами. Філогенетичний аналіз показав, що GlMP-18 і BYMV-Gl-SV-20 мають між собою ідентичність 100% і за нуклеотидною, і за амінокислотною послідовністю. Обидва українські ізоляти належать до групи Monocot. Ідентичність двох гладіолусних ізолятів GlMP-18 і BYMV-Gl-SV-20 за ділянкою гена СР з територіально віддалених областей країни та у різні роки відбору свідчать  про спільне походження ізолятів та ймовірне їх поширення посадковим матеріалом.