EVOLUTIONARY RELATIONSHIP OF UKRAINIAN ISOLATE OF ODONTOGLOSSUM RINGSPOT VIRUS: DOI 10.17721/1728.2748.2022.89.19-22

A. Ponomarenko; H.  Korotieieva; O. Andriichuk

Автор(и)

А. Пономаренко Київський національний університет імені Тараса Шевченка, Київ, Україна
Ганна Коротєєва Київський національний університет імені Тараса Шевченка
О. Андрійчук Київський національний університет імені Тараса Шевченка, Київ, Україна

Ключові слова:

орхідні, ВКПО, ЗТ-ПЛР, філогенетичний аналіз

Анотація

Вірус кільцевої плямистості одонтоглосуму (ВКПО) є одним з найнебезпечніших вірусів декоративних орхідей. Захворювання, викликані цим вірусом, можуть призвести до зниження фенотипових відмінностей колекцій орхідей і як наслідок – їх повного виснаження. У цій роботі досліджувалося можливе походження українського ізоляту ВКПО, виділеного з рослин колекції ботанічного саду імені О.В. Фоміна Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Досліджено властивості нуклеотидних послідовностей РНК-залежної РНК-полімерази (RdRp) та капсидного білку ВКПО. РНК ВКПО виділяли з листків Cymbidium hybridum, відібраних з колекції ботанічного саду імені О.В. Фоміна. В подальшому послідовності РНК вірусу були ампліфіковані за допомогою RT-PCR та секвеновані. Отримані послідовності порівнювали на рівні нуклеотидів з ізолятами ВКПО, доступними в GenBank. При проведенні філогенетичного аналізу було виявлено, що досліджуваний ізолят ВКПО може мати спільний корінь з кількома південнокорейськими ізолятами.

Посилання

Zettler FW, Wistler GC, Elliot MS, Ko N-J. Viruses of orchids and their control, Plant. Disease. 1990; 74: 621-626.

Lee Ch-H, Zheng Y-X, Jan F-J The Orchid-Infecting viruses found in the 21st century Orchid Biotechnology III. 2017; 145-164 : https://doi.org/10.1142/9789813109223_0009

Ahmad S, Chen G, Huang J, Yang K, Hao Y, Zhou Y & Peng D. Beauty and the pathogens: A leaf-less control presents a better image of Cymbidium orchids defense strategy. Frontiers in Plant Science, 2022; 1; 1-13.

Pant RP, Baljeet Kaur Virus diseases of orchids. RASSA Journal of Science for Society. 2022.; 4 (1): 1-15.

Ajjikuttira PA, Lim-Ho CL, Woon MH, Ryu KH, Chang CA, Loh CS, Wong SM Genetic variability in the coat protein genes of two orchid viruses: Cymbidium mosaic virus and Odontoglossum ringspot virus. Arch. Virol. 2002; 147: 1943–1954.

Wong SM., Chng CG, Lee YH, Tan K, Zettler FW Incidence of Cymbidium Mosaic and Odontoglossum Ringspot Viruses and Teir Signifcance in Orchid Cultivation in Singapore. Crop Prot. 1994; 13:235–239, https://doi.org/10.1016/0261-2194(94)90084-1

Cánovas SE, Ballari MC and Nome CF. First report of Cymbidium mosaic virus and Odontoglossum ring spot virus in Argentina. Australasian Plant Dis. Notes. 2016; 11: 2. http://dx.doi.org/10.1007/s13314-015-0189-7.

Korotieieva HV, Polischuk VP. [Viral diseases in the orchid collection of Academician O.V. Fomin Botanical Gardens of Taras Shevchenko Kyiv National University] [Scientific Notes of NaUKMA]. 2001; 19(2): 399-400. Ukrainian

Polischuk V, Korotyeyeva G, Bysov A, Lavrentieva A Spreading of virus infection in the orchid collection in Ukraine. Plant science. Sofia. 2007; XLIV (3). : 213-216.

Chng CG., Wong SM., Mahtani PH, Loh CS, Goh CJ, Chung MC-M, Watanabe Y The complete sequence of a Singapore isolate of Odontoglossum ringspot virus and comparison with tobamoviruses. Gene. 1996; 171: 155–161.

Panjaitan MVT, Mahfut, Handayani TT, Wahyuningsih S Various ORSV infection symptoms on Ceratorhiza induction in orchid plants. Journal of Sustainability Science and Technology. 2021.1(2): 64-71.

Manfut Identification and Efforts to Control Infection Odontoglossum ringspot virus (ORSV) on Orchid. International Journal of Engineering, Science and Information Technology, 2021, 1(1):25-29.

Pearson MN, Cole JS Further observations on the effects of Cymbidium mosaic virus and Odontoglossum ringspot virus on the growth of Cymbidium orchids [Electronic resource]. Journal of Phytopathology.1991: 131(3); 193-198. – Available at: https://doi.org/10.1111/j.1439-0434.1991.tb01187.x

Yamane K, Oyama K, Iuchi E, Ogawa H, Suzuki T, Natsuak T RT-PCR detection of Odontoglossum ringspot virus, Cymbidium mosaic virus, and Tospoviruses and association of infections with leaf yellowing symptoms in Phalaenopsis Journal of Phytopathology. 2008; 156: 268–273. http://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0434.2007.01352.x

Hu JS, Ferreira S, Xu MQ, Detection of Cymbidium Mosaic Virus, Odontoglossum Ringspot Virus, Tomato Spotted Wilt Virus, and Potyviruses Infecting Orchids in Hawaii, Department of Plant Pathology. 1993:464-468. https://www.apsnet.org/publications/PlantDisease/BackIssues/Documents/1993Articles/PlantDisease77n05_464.PDF

Dubs M C, Van Regenmortel MH Odontoglossum ringspot virus coat protein: sequence and antigenic comparisons with other tobamoviruses. Arch. Virol. 1990; 115: 239–249.

Gibbs A Evolution and origins of tobamoviruses Phil. Trans. R. Soc. Lond. 1999; B 354: 593–602. http://doi.org/10.1098/rstb.1999.041

Sherpa A, Tusar B, Hallan V, Zaidi A A Detection of Odontoglossum ringspot virus in orchids from Sikkim, India. Australasian Plant Pathology – Australas plant pathol. 2006; 35. 69-71.

Rashmi ER, Pant R, Baranwal V, Jain R Detection of orchid viruses and molecular characterization of odontoglossum ringspot virus (ORSV) isolates. Indian Council of Agricutural Research. 2021; 91(8):

Yoon JY, Chung BN, Choi SK. High sequence conservation among Odotoglossum ringspot virus isolates from orchids. Virus Genes. 2011; 42(2):261-7.